基础教育办学管理部内设三个科室，分别为：教育教学指导科、合作办学科、综合科。
基础教育办学管理部党总支书记：邱宏志
基础教育办学管理部主任兼总督学：梁广
基础教育办学管理部副主任：赵欣欣
基础教育办学管理部副主任：丁金霞（挂职）
基础教育办学管理部教育教学指导科科长：苏炜
基础教育办学管理部合作办学科：
基础教育办学管理部综合科职员：李金珠 钟丽
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